Detalles de la búsqueda
1.
SND1 binds SARS-CoV-2 negative-sense RNA and promotes viral RNA synthesis through NSP9.
Cell
; 186(22): 4834-4850.e23, 2023 10 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37794589
2.
The function of Wtap in N6-adenosine methylation of mRNAs controls T cell receptor signaling and survival of T cells.
Nat Immunol
; 23(8): 1208-1221, 2022 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35879451
3.
Distal and proximal cis-regulatory elements sense X chromosome dosage and developmental state at the Xist locus.
Mol Cell
; 82(1): 190-208.e17, 2022 01 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34932975
4.
Combinatorial microRNA activity is essential for the transition of pluripotent cells from proliferation into dormancy.
Genome Res
; 2024 May 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38719471
5.
A systematic benchmark of machine learning methods for protein-RNA interaction prediction.
Brief Bioinform
; 24(5)2023 09 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37635383
6.
Single-cell RNA sequencing uncovers the nuclear decoy lincRNA PIRAT as a regulator of systemic monocyte immunity during COVID-19.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(36): e2120680119, 2022 09 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35998224
7.
A Data-Mining Approach to Identify NF-kB-Responsive microRNAs in Tissues Involved in Inflammatory Processes: Potential Relevance in Age-Related Diseases.
Int J Mol Sci
; 24(6)2023 Mar 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36982191
8.
Kinetics of Xist-induced gene silencing can be predicted from combinations of epigenetic and genomic features.
Genome Res
; 29(7): 1087-1099, 2019 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31175153
9.
Multi-ancestry genome-wide association study of asthma exacerbations.
Pediatr Allergy Immunol
; 33(6): e13802, 2022 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35754128
10.
TriPepSVM: de novo prediction of RNA-binding proteins based on short amino acid motifs.
Nucleic Acids Res
; 47(9): 4406-4417, 2019 05 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30923827
11.
Identifying lncRNA-mediated regulatory modules via ChIA-PET network analysis.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 292, 2019 May 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31142264
12.
pysster: classification of biological sequences by learning sequence and structure motifs with convolutional neural networks.
Bioinformatics
; 34(17): 3035-3037, 2018 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29659719
13.
ssHMM: extracting intuitive sequence-structure motifs from high-throughput RNA-binding protein data.
Nucleic Acids Res
; 45(19): 11004-11018, 2017 Nov 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28977546
14.
Genome-wide Chromatin Profiling of Legionella pneumophila-Infected Human Macrophages Reveals Activation of the Probacterial Host Factor TNFAIP2.
J Infect Dis
; 214(3): 454-63, 2016 08 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27130431
15.
Transfer learning identifies sequence determinants of cell-type specific regulatory element accessibility.
NAR Genom Bioinform
; 5(2): lqad026, 2023 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37007588
16.
Genome-wide measurement of RNA dissociation from chromatin classifies transcripts by their dynamics and reveals rapid dissociation of enhancer lncRNAs.
Cell Syst
; 14(10): 906-922.e6, 2023 10 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37857083
17.
Towards in silico CLIP-seq: predicting protein-RNA interaction via sequence-to-signal learning.
Genome Biol
; 24(1): 180, 2023 08 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37542318
18.
A computational map of the human-SARS-CoV-2 protein-RNA interactome predicted at single-nucleotide resolution.
NAR Genom Bioinform
; 5(1): lqad010, 2023 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36814457
19.
MeMotif: a database of linear motifs in alpha-helical transmembrane proteins.
Nucleic Acids Res
; 38(Database issue): D181-9, 2010 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19910368
20.
Network Embedding Across Multiple Tissues and Data Modalities Elucidates the Context of Host Factors Important for COVID-19 Infection.
Front Genet
; 13: 909714, 2022.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35903362